События мультфильма «Призрак в доспехах: Синдром одиночки - Одиннадцать индивидуалистов» разворачиваются в будущем после окончания Четвертой мировой войны. Человечество научилось переносить сознание в роботизированные тела. Для многих людей это настоящее благо, ведь можно покинуть больное тело и стать здоровым андроидом. Макото Кусанаги стала роботом в девять лет, после страшной аварии. Прошло время, девочка сменила детское тело на взрослое и теперь служит в Девятом Отделе Общественной Безопасности. Данный отдел занимается борьбой с киберпреступлениями против человека, ведь хакеры легко могут влиять на сознание андроидов и подчинять их себе. А в это время почти половина населения планеты начинает устраивать бунты против технического прогресса, не желая стирать грань между машиной и человеческой личностью.