Сюжет мультфильма "Призрак в доспехах 2.0", рассказывает о далеком будущем. В мире появились новые технологии, и большинство людей вживили себе в организм всевозможные имплантанты. Но оказывается, что это сильно повлияло на жизнь в целом. Появились технологии, которые способны взламывать человеческий мозг и управлять его разумом. Одним из таких людей стал Кукловод. Власти давно пытается его поймать, но хитрый гений действует с особой осторожностью. Он совершенно не оставляет следов и постоянно действует скрытно. Необходимо постараться, чтобы словить опасного человека, способного контролировать целый мир.