Главными героями мультфильма «Черепашки ниндзя: Восстание» становятся четыре веселых парня по имени Леонардо, Микеланджело, Рафаэль, Донателло. Эти веселые черепахи были названы в честь великих людей, которых знает весь мир. Главные герои изучают искусство боя, чтобы суметь противостоять своим врагам, которые никак не могут оставить этих мутантов в покое. Но вот ребята вновь отправляются навстречу приключениям. Они начинают изучать много нового, заводят новые знакомства, а также получают массу неизведанной ранее информации. Теперь у главных героев еще больше врагов. Черепахи вместе со своим сенсеем должны научиться еще многому. Смогут ли главные герои одолеть всех своих врагов?