Главный герой анимэ «Лепестки реинкарнации» – старшеклассник Тое Сэндзи, который живет в тени своего талантливого брата. В его классе появляется новенька ученица Хаито, которая начинает с ним дружить и рассказывает тайну о Ветви Реинкарнации. Это секретный дар, способный пробудить способности из прошлой жизни. Вот только это может проявиться как дар Великого, приносящий пользу обществу, так и сила Грешника, что несет угрозу человечеству. Не задумываясь о последствиях, Тоя решается использовать Ветвь и получает долгожданную силу. И так случается, что главный герой становится Великим и начинает собственную борьбу против Грешников.