События сериала «Курьерский особой важности» разворачиваются в самый разгар Первой мировой войны, когда опытный офицер российской контрразведки капитан Василий Щепкин получает под свое командование специальный отряд. Поставлена критически важная цель – заблокировать передачу конфиденциальной военной информации зарубежным агентам. А все дело в том, что из Генерального штаба бесследно исчезли секретные документы с подробной схемой дислокации дальневосточных войсковых соединений. Сама кража поражает дерзостью и экзотичностью, ведь нападавший действовал в маске и костюме японского ниндзя. Действуя в строжайшей тайне, контрразведчики выдают себя за работников кинематографа и отправляются в погоню на Транссибирском экспрессе, следующем до Владивостока.