События анимэ «Гаргантия на зеленой планете» разворачиваются в далеком будущем, когда человечество покинуло изнуренную Землю и теперь ведет непрерывную войну в открытом космосе против загадочной расы Хидаасу. Молодой лейтенант Ледо, не знавший с самого детства ничего, кроме строгой военной дисциплины и битв, во время очередного сражения попадает в пространственную аномалию. Его вместе с роботом выбрасывает на Землю, которая, вопреки легендам, оказалась не погибшей, а полностью покрытой океаном. Попав на борт огромной плавучей флотилии «Гаргантия», Ледо сталкивается с абсолютно чуждым для себя укладом, ведь люди здесь живут в мире, занимаются трудом и ценят взаимопомощь. Сближаясь с жизнерадостной девушкой-курьером Эми, главный герой впервые учится простым человеческим радостям и открывает для себя ценность мирной жизни.