Когда-то Хамато Йоши завел себе четырех черепашек. Однако после контакта с мутагеном он сам превратился в полукрысу Сплинтера, а его питомцы сильно увеличились в размере и приобрели человеческие качества. В таком виде им пришлось спрятаться под землей в коллекторе. сплинтер воспитал черепашек как родных детей, обучил их боевым искусствам, научил размышлять философски. И вот по прошествии пятнадцати лет герои наконец могут выйти на улицы Нью-Йорка и лицом к лицу столкнуться с опасностями. Леонардо, Донателло, Рафаэль и Микеланджело стоят на страже спокойствия мирных жителей.