Главный герой мультсериала «Сердце галактики» – космический путешественник Ли Юэсу, который находит пропавший много лет назад корабль «Шанцзя». Это было судно с иммигрантами, на которое, оказывается, кто-то напал. Ли Юэсу полагает, что те, кто напал на корабль, несомненно, атакуют человечество. Весь регион Кониль, в который также входит Земля, предупрежден, но враг оказывается сильнее, и высокотехнологичная инопланетная раса уничтожает все населенные людьми планеты. Остается только одно место, где обитают люди – самая отдаленная планета в центре галактики. Главный герой срочно отправляется туда, чтобы подготовиться к решающему бою.