События многосерийного анимэ «Эрго Прокси» разворачиваются в будущем, которое стало темным и пустынным. Жизнь возможна теперь только в одном городе-куполе Ромдо, только там осталась цивилизация. Руководит Ромдо старик Донов Мейер, которому помогают роботы. Людям Мейер не доверяет, но и с роботами тоже может случится непредсказуемое. Все дело в том, что несколько лет назад вирус Когито мгновенно превратил послушных роботов в жестоких убийц. Внучка главы города Рил решает провести собственное расследование, чтобы понять откуда пришел вирус, и кто его создал. Девушка уезжает из Ромдо вместе с роботом Пино и отправляется в смертельно-опасное путешествие по мертвому миру…