Главные герои фильма «Школа магических зверей. Тайна подземелья» – друзья-подростки Ида Кроненберг и Йохан Виланд, которые находятся в ожидании важного события. Школа магических зверей, в которой учатся подростки, готовится к двадцатилетнему юбилею. У всех учеников и их говорящих чудо-животных полно забот, ведь праздник должен выйти красивым и грандиозным. Тем временем в стенах школы происходит что-то необъяснимое. Каждую ночь там появляются какие-то странные ямы. Ида Кроненберг и Йохан Виланд, как самые лучшие ученики, вместе с волшебными питомцами должны понять, что за тайна скрывается под зданием школы. Главных героев ждет невероятное путешествие в подземелье, полное опасностей и странных существ.