События фильма «Ты здесь, Бог? Это я, Маргарет» разворачиваются в середине семидесятых годов и рассказывают историю обычной двенадцатилетней американки. У Маргарет наступил непростой период – родители переезжают из Нью-Йорка в пригород Джерси. Для девочки это означает смену школы, новых одноклассников и расставание с любимой бабушкой. Здесь Маргарет быстро обзаводится новыми подругами, вместе с которыми основательно готовится к подростковому возрасту. Девочки обсуждают мальчиков, учатся с ними флиртовать, рассматривают фотографии в журналах для взрослых. Интересы Маргарет круто меняются после того, как в школе дают задание написать сочинение на тему религии. Школьница узнает многое о своей семье, оказывается, что родители ее мамы - убежденные христиане-протестанты, они были против того, чтобы дочь выходила замуж за еврея. Вот почему, оказывается, Маргарет никогда не видела бабушку и дедушку с той стороны. Главная героиня решает сходить в синагогу, а потом на собрание к протестантам, чтобы понять, какая религия правильная.