В центре сюжета этого фильма группа учёных из Сан-Франциско, именно в этом городке проходят все события. Несколько учёных пытаются выжить после эпидемии, которая началась. Чума уничтожила больше половины человечества. В это время Цезарь хочет сохранить правительство над его разумными обезьянами. Люди, которые остались живы, спрятались в подземные укрытия и отдали свои судьбы в руки учёных, которые пытаются найти отгадку того, как выйти из данной ситуации. Учёные хотят решить вопрос, а остальные пытаются выжить.