События фильма «Чекист» разворачиваются во времена «красного террора», когда в период Гражданской войны проводились карательные действия против классовых врагов и контрреволюционеров. Сотрудники ЧК ежедневно отправляют людей на казнь лишь за то, что они жили немногим лучше, чем остальные. Бесконечные списки тех, кто подлежит ликвидации, приговор одинаков для всех – расстрел, и каждый день грузовик, наполненный окровавленными телами, покидает территорию тюрьмы. Главный герой - председатель губернского ЧК Андрей Срубов, который глубоко убежден, что жертвы необходимы в эти тяжелые времена. Однако фанатичная жестокость, личная драма и сексуальные отклонения Срубова приводят к закономерному итогу...