Главный герой мультфильма «Счастливого Хэллоуина, Скуби-Ду!» - отважный дог, который постоянно оказывается в комичных ситуациях. В этот раз Скуби-Ду вместе со своими друзьями готовится к празднованию Хэллоуина. Веселая компания уже приготовила страшные наряды, чтобы пройтись по ночному городу от одной двери к другой и насобирать сладких конфет. Однако в этот раз любимый праздник внезапно приобрел совсем несладкий оттенок. Оказывается, что все тыквенные поля заразились какой-то ядовитой тиной, а сами тыквы превратились в светящиеся летающие объекты. Мало того: у летающих тыкв есть главарь огромных размеров, который уничтожает все на своем пути. Только Скуби-Ду и его друзья знают, как справиться с надвигающейся напастью и разгадать тайну летающих тыкв.