События фильма "Наруто 6" разворачиваются все в тех же Пяти странах, которые в последнее время пытаются контролировать порядок. Из всех деревень стали пропадать синоби с Кровавым даром. Единственным нетронутым местом стала деревня Листвы. Это естественно вызывает большие подозрения и надо выяснить, что же это означает. Но в скором времени над деревней появится символ, который будет символизировать начало новой войны. Прошлые события повторяются и теперь все снова находятся в страшной опасности. Надо будет всеми силами сражаться со своими врагами, но на этот раз противник будет куда хитрее.